Vergi dairelerinden mükelleflere yazılar tebliğ edilerek bu yazılar içerisinde mükelleflerin kullandığı faturaların sahte fatura olduğu ve bu faturaların kayıtlardan çıkartılarak ilgili KDV, geçici vergi, kurum, gelir ve diğer ilgili beyannamelerin düzeltilmesi gerektiği tebliğ edilmektedir.
Uygulamada bazı  vergi daireleri ise;   mükelleflere yazı tebliğ etmeyip, pratiklik  açısından telefonla mükellefleri  arayıp,  bu durumu  izah edip, problemli  faturaları  geri çekerek  düzeltme beyannamesi  verilmesi  gerektiğini şifai olarak  söylemektedir.
Bilindiği gibi,  Türkiye çapında sorunlu  faturalar  çığ  gibi büyüyerek bütün iş alemini sarmış durumdadır.  Yazılan  bir “vergi tekniği raporuna” istinaden Türkiye çapında  o mükelleften mal  alan  bütün mükellefler  özel esaslara alınmaktadır.  Ayrıca, özel esaslara alınan mükelleflerden mal  alanlar da  ikinci aşamada  KOD’a alınarak bunlar da aynı şekilde özel esaslara geçirilmektedir.  Böylece,  ikinci ve üçüncü seviyede  özel  esaslara alınan firmalardan  mal  alanların  KDV beyannamelerinin düzeltilmesi talep edilmektedir.  (Müfettişler tarafından düzenlenen  raporların  ekinde  özel esaslara alma tablosu eklenerek, buralarda rapora ilişkin bilgiler, hakkında  rapor düzenlenen  mükelleflere ilişkin bilgiler ve ayrıca rapora istinaden  özel esaslar kapsamında alınacak mükellefler ayrıntılı olarak belirtilmektedir)
Yukarıda yer verilen problemlerin   çözümlenebilmesi için  KDV beyannamesinin  VEDOP  sistemine girilerek, önce izahat notu yazılmalı  ve daha sonra “ihtirazi kayıtla düzeltilip”  bu  düzeltme neticesinde alınan  tahakkuk  fişlerinin 30 gün içerisinde yargıya taşınmasında yarar olacaktır.  Ayrıca bu konuda  vergi dairesine düzeltme yapılmadan  önce ayrıntılı bir dilekçe verilmesi gerekecektir.
Düzeltme sonucunda çıkan tahakkuk  fişleri ve üzerinde yer alan  ilgili  vergiler, gecikme faizleri ve varsa VZC  yargıya taşınarak  sorun bir ölçüde  çözümlenmiş  olabilecektir.   Bu  aşamada  ödeme belgeleri, banka dökümleri ve diğer evrakların da dilekçe ekinde vergi dairesine verilmesi  gerekecektir.[1] Bkz.  2010/2  sayılı Maliye Bakanlığı  İç Genelgesi.
Dr. Mustafa Alpaslan